【中国科学报】新技术系统胜利利用于植物三维基因组学研讨

核心提醒: 11月14日,华中农业大学作物遗传改进国度重点试验室教授李兴旺和李国亮课题组受邀在《植物科学趋势》在线发表了综述文章。


11月14日,华中农业大学作物遗传改进国度重点试验室教授李兴旺和李国亮课题组受邀在《植物科学趋势》在线发表了综述文章。

三维基因组学是基因组学研讨的热门前沿领域之一。目前,以人类细胞系和动物细胞为研讨对象,生物学家已经开发了很多高通量的三维基因组学研讨技术。其中一些技术系统已经胜利利用于植物三维基因组学研讨。

李兴旺和李国亮课题组致力于三维基因组学和表观基因组学研讨。前期,他们以人类细胞系和动物细胞为研讨资料,先后开发了Long-read ChIA-PET和DLO Hi-C两项技术系统。2019年,他们首次在玉米和水稻中树立Long-read ChIA-PET技术系统,并刻画了玉米和水稻的三维基因组图谱。2020年,他们又用DLO Hi-C技术刻画了玉米雌雄穗的三维基因组图谱。

这篇综述文章介绍了植物三维基因组学的研讨技术。他们首先介绍了3C、Hi-C、in situ Hi-C、DLO Hi-C、ChIA-PET和HiChIP等利用于植物三维基因组学研讨的技术,论述了如何利用这些技术解析植物基因组的三维构造,并特殊关注了ChIA-PET和Hi-ChIP检测的染色质环构造。文章还提出目前植物三维基因组学研讨技术的优势以及面临的挑衅,对未来植物三维基因组学技术的开发以及三维基因组构造的解析具有启发意义。(欧阳维枝)

相干论文信息:https://doi.org/10.1016/j.tplants.2020.10.007

原文链接:http://news.sciencenet.cn/sbhtmlnews/2020/11/358840.shtm